Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL11Q9Y3B7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL11Q9Y3B7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms