Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A6Q9Y2P4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms