Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX2IPQ9Y2D8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX2IPQ9Y2D8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms