Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms