Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y278

HS3ST2, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST2Q9Y278 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HS3ST2Q9Y278 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HS3ST2Q9Y278 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms