Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms