Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POMPQ9Y244 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POMPQ9Y244 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POMPQ9Y244 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POMPQ9Y244 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms