Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEU3Q9UQ49 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEU3Q9UQ49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms