Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM35Q9UPQ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM35Q9UPQ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms