Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAF8Q9UPN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCAF8Q9UPN6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCAF8Q9UPN6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms