Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN11Q9UMQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN11Q9UMQ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN11Q9UMQ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms