Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF490Q9ULM2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF490Q9ULM2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms