Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC13A4Q9UKG4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms