Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA1Q9UJY5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA1Q9UJY5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms