Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH22Q9UJ99 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms