Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSRAQ9UJ68 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSRAQ9UJ68 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms