Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms