Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP2Q9UHC6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms