Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1BQ9UEU0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms