Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPASTQ9UBP0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms