Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms