Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL9Q9P2J3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL9Q9P2J3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms