Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RRBP1Q9P2E9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RRBP1Q9P2E9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms