Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL20A1Q9P218 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL20A1Q9P218 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms