Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHRF1Q9P1Y6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms