Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRD1Q9P1U0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms