Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms