Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NINJ2Q9NZG7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINJ2Q9NZG7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms