Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH8Q9NYR8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH8Q9NYR8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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