Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MIS18AQ9NYP9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIS18AQ9NYP9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms