Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms