Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA2D2Q9NY47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D2Q9NY47 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms