Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYBUQ9NX95 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYBUQ9NX95 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms