Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TMEM260Q9NX78 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM260Q9NX78 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms