Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB20Q9NX57 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB20Q9NX57 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms