Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ASF1BQ9NVP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms