Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED17Q9NVC6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MED17Q9NVC6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms