Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30AQ9NV96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms