Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
FOXD4L1Q9NU39 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms