Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RRP7BPQ9NSQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP7BPQ9NSQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms