Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPRMQ9NS64 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPRMQ9NS64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms