Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 53e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-219ENST00000635935 2000 ntTSL 544.02■■■■■ 4.643e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.992e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.853e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-210ENST00000531571 1535 ntTSL 538.91■■■■□ 3.823e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.783e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CARD9-203ENST00000460290 1061 ntTSL 338.44■■■■□ 3.743e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 237.56■■■■□ 3.63e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 337.37■■■■□ 3.573e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.463e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-204ENST00000527576 790 ntTSL 536.53■■■■□ 3.443e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNM1-210ENST00000527527 459 ntTSL 435.68■■■■□ 3.38e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.283e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BAP1-210ENST00000490917 521 ntTSL 535.45■■■■□ 3.273e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-208ENST00000527680 569 ntTSL 234.94■■■■□ 3.183e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-206ENST00000466014 1700 ntTSL 1 (best)34.76■■■■□ 3.163e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 234.57■■■■□ 3.123e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.053e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNM1-208ENST00000527103 308 ntTSL 434.1■■■■□ 3.058e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WDR1-209ENST00000505851 715 ntTSL 233.7■■■□□ 2.983e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZSCAN5A-216ENST00000592679 923 ntTSL 233.38■■■□□ 2.933e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-204ENST00000562623 333 ntTSL 233.19■■■□□ 2.93e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 BNIP3-204ENST00000633835 1062 ntTSL 332.86■■■□□ 2.853e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NUDT14-201ENST00000339418 570 ntTSL 232.27■■■□□ 2.763e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)32.26■■■□□ 2.754e-60■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 432.26■■■□□ 2.753e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.743e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TBC1D14-205ENST00000444368 663 ntTSL 331.94■■■□□ 2.73e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 231.92■■■□□ 2.73e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-212ENST00000564822 314 ntTSL 431.73■■■□□ 2.673e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.673e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-226ENST00000570051 735 ntTSL 231.73■■■□□ 2.673e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-204ENST00000586365 789 ntTSL 231.73■■■□□ 2.673e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.668e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-206ENST00000529076 482 ntTSL 331.26■■■□□ 2.593e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SYMPK-209ENST00000598155 1603 ntTSL 531.02■■■□□ 2.563e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NUDT14-206ENST00000551024 1042 ntTSL 1 (best)31.02■■■□□ 2.563e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 NUDT14-203ENST00000546553 527 ntTSL 430.89■■■□□ 2.543e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AGPAT2-204ENST00000472820 808 ntTSL 1 (best)30.56■■■□□ 2.483e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CIAO1-202ENST00000469320 565 ntTSL 430.52■■■□□ 2.483e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PITPNM1-203ENST00000524901 550 ntTSL 430.5■■■□□ 2.478e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-214ENST00000493924 1573 ntTSL 530.45■■■□□ 2.463e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF672-205ENST00000505503 583 ntTSL 330.37■■■□□ 2.458e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 C8orf33-203ENST00000529593 495 ntTSL 530.17■■■□□ 2.423e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.413e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRABD-205ENST00000463233 2404 ntTSL 1 (best)29.83■■■□□ 2.373e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-213ENST00000584567 932 ntTSL 229.78■■■□□ 2.363e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-209ENST00000479508 741 ntTSL 229.77■■■□□ 2.363e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-203ENST00000381117 798 ntTSL 1 (best)29.77■■■□□ 2.363e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.353e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.348e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.318e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-205ENST00000527779 842 ntTSL 229.44■■■□□ 2.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.33e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CXXC1-210ENST00000587396 476 ntTSL 229.25■■■□□ 2.273e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SLC45A4-205ENST00000520137 835 ntTSL 329.02■■■□□ 2.248e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CARD9-206ENST00000489932 1912 ntTSL 528.92■■■□□ 2.223e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-216ENST00000498313 988 ntTSL 528.85■■■□□ 2.213e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SLC45A4-206ENST00000521804 726 ntTSL 328.77■■■□□ 2.28e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.183e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-207ENST00000549328 1003 ntTSL 328.69■■■□□ 2.183e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-203ENST00000547614 653 ntTSL 228.69■■■□□ 2.183e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.073e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.063e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.063e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.033e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-216ENST00000529438 572 ntTSL 427.63■■■□□ 2.013e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AP5Z1-205ENST00000490487 917 ntTSL 327.53■■■□□ 23e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 C8orf33-202ENST00000524395 1125 ntTSL 1 (best)27.49■■□□□ 1.993e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.993e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)27.44■■□□□ 1.983e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC4-203ENST00000447216 980 ntTSL 227.43■■□□□ 1.983e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.953e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.953e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.948e-9■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.923e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 AP006621.5-201ENST00000623846 1139 nt26.93■■□□□ 1.93e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 GPAT4-209ENST00000521349 842 ntTSL 226.82■■□□□ 1.883e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 GPAT4-202ENST00000518628 1063 ntTSL 326.82■■□□□ 1.883e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SCRN2-209ENST00000582459 1624 ntTSL 526.8■■□□□ 1.883e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 LINC00896-201ENST00000423736 607 nt26.78■■□□□ 1.883e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNPS1-204ENST00000561518 1092 ntTSL 526.64■■□□□ 1.863e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.833e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D5-202ENST00000525420 651 ntTSL 326.43■■□□□ 1.823e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.823e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CIAO1-204ENST00000491394 748 ntTSL 226.3■■□□□ 1.83e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 526.26■■□□□ 1.793e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.783e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.04■■□□□ 1.763e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.753e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 SHC2-206ENST00000590222 951 ntTSL 526■■□□□ 1.753e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 RNF166-211ENST00000569478 571 ntTSL 425.95■■□□□ 1.743e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-210ENST00000503827 451 ntTSL 525.8■■□□□ 1.723e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.729e-7■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-202ENST00000339046 1202 ntTSL 225.71■■□□□ 1.713e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.713e-6■■■■□ 26.4
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