Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB3Q9NQW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB3Q9NQW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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