Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
XPNPEP3Q9NQH7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPNPEP3Q9NQH7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms