Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH12Q9NPG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH12Q9NPG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms