Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB9BQ9NP90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB9BQ9NP90 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms