Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VTA1Q9NP79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms