Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSU72Q9NP77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSU72Q9NP77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSU72Q9NP77 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms