Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGAP3Q9NP61 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGAP3Q9NP61 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms