Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLD4Q9HCU8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLD4Q9HCU8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms